- Essen, trinken und gesund sein:Der Leitfaden der Harvard Medical School für gesunde Ernährung (2001)
- Nutritional Epidemiology, 3. Auflage (2013) (zusammen mit Meir Stampfer herausgegeben)
- Willett's Nutritional Epidemiology, zweite Auflage (2018) (herausgegeben von Willett)
- The Salt Sugar Fat Fix:How the Food Giants Us (2020) (gemeinsam mit Marion Nestle verfasst)
Zusätzlich zu diesen Büchern hat Walter Willett wissenschaftliche Artikel, Rezensionen und politische Empfehlungen in verschiedenen medizinischen und ernährungswissenschaftlichen Fachzeitschriften veröffentlicht.