Ein hoher Jacobsen-Index weist auf einen Baum mit vielen kurzen inneren Ästen hin, was auf eine schnelle Ausbreitung der Taxa oder eine hohe Charakterentwicklungsrate zurückzuführen sein kann. Ein niedriger Jacobsen-Index weist auf einen Baum mit wenigen kurzen inneren Ästen hin, was auf eine langsame Ausstrahlung der Taxa oder eine niedrige Charakterentwicklungsrate zurückzuführen sein kann.
Der Jacobsen-Index wird häufig zum Vergleich der relativen Verzweigung verschiedener phylogenetischer Bäume verwendet und kann zur Beurteilung der Passung verschiedener Evolutionsmodelle an einen bestimmten Datensatz verwendet werden.