Am Ende von Danny Phantom besiegt Danny seinen Erzfeind Vlad Plasmius und rettet die Welt vor seinen bösen Plänen. Es gelingt ihm auch, seine Eltern aus der Geisterzone zu befreien und sie werden als Familie wieder vereint. Danny und seine Freunde können zu ihrem normalen Leben zurückkehren, sind sich jedoch der Welt der Geister und der damit verbundenen Verantwortung bewusst.
Die Serie endet damit, dass Danny und seine Freunde in den Sonnenuntergang fliegen, bereit, sich allen Herausforderungen zu stellen, die auf sie zukommen.