Filmauftritte:
- „Spectre“ (2015) als Marco Sciarra
- „Die glorreichen Sieben“ (2016) als Nate Love
- „The Belko Experiment“ (2016) als Mike Milch
- „The Limehouse Golem“ (2016) als Inspektor Kildare
- „The Girl on the Train“ (2016) als Dr. Kamal Abdic
– „A Cure for Wellness“ (2017) als Enrique
- „Jumanji:Willkommen im Dschungel“ (2017) als Professor Sheldon Oberon
- „Tomb Raider“ (2018) als Lu Ren
- „Pacific Rim:Uprising“ (2018) als Caleb Loomis
– „Black Adam“ (2022) als Ishmael
Fernsehauftritte:
- „The Following“ (2013) als Theo Noble
- „True Detective“ (2014) als Ginger
- „Narcos“ (2015) als Javier Peña
– „The Son“ (2017) als Eli McCullough
– „Westworld“ (2018–2020) als Hector Escaton
– „The Boys“ (2019–2022) als Eagle the Archer
– „The Terminal List“ (2022) als Ben Edwards
– „The Old Man“ (2022) als Raymond Waters
Neben der Schauspielerei hat Juan Root auch bei mehreren Kurzfilmen und Episoden von Fernsehserien wie „The Son“ und „The Terror“ Regie geführt.