Filme
* The Stalking Moon (1968) - als Sam Varner
* Die Heuschrecke (1970) - als Jack Harris
* Die andere Seite des Berges (1975) - als Löwe
* Das letzte verheiratete Paar in Amerika (1980) - als John
* Das beste kleine Bordell in Texas (1982) - als Sheriff Ed Earl Dodd
* S.O.B. (1981) - als Direktor
* Der große Rote (1980) - als Kapitän
* Ein bisschen Sex (1982) - als Dr. Howard „H.B.“ Bäcker
* Das Juwel vom Nil (1985) - als Omar
* Some Kind of Wonderful (1987) - als Keith
* Drei Männer und ein Baby (1987) - als Peter
* Die nackte Waffe:Aus den Akten der Polizei! (1988) - als Chef
* The Naked Gun 2 1/2:The Smell of Fear (1991) - als Chef
* Der Weihnachtsmann (1994) - als Neil
* Der Weihnachtsmann 2 (2002) - als Neil
* Der Weihnachtsmann 3:Die Fluchtklausel (2006) - als Neil
Fernsehen
* Die Ärzte (1969-1971) – als Dr. David
* Die Bob Newhart Show (1972–1978) – als Bob Hartley
* Seife (1977–1981) – als Benson
* Leeres Nest (1988–1995) – als Dr. Harry Weston
* Die goldenen Mädchen (1985–1992) – als Dr. Harry Weston
* Der Goldene Palast (1992) – als Dr. Harry Weston
Dies ist nur eine unvollständige Liste, und Mulligan trat im Laufe seiner Karriere in vielen anderen Projekten auf.
Er war bekannt für sein komödiantisches Timing und seine Fähigkeit, sowohl ernste als auch humorvolle Charaktere darzustellen. Er war ein hochgeschätzter Schauspieler und seine Auftritte erfreuen auch heute noch viele Menschen.