Im Verlauf der Serie erhalten die Mädchen mysteriöse Nachrichten und Drohungen von „A“, der offenbar jede ihrer Bewegungen und Geheimnisse kennt. Sie beginnen, jeden um sie herum zu verdächtigen, einschließlich ihrer Freunde, Familienmitglieder und sogar einander. Die Mädchen müssen zusammenarbeiten, um die Identität von „A“ aufzudecken und ihre Qual zu beenden, während sie sich gleichzeitig mit ihren eigenen persönlichen Problemen und Geheimnissen auseinandersetzen.
„Pretty Little Liars“ erforscht Themen wie Freundschaft, Verrat, Geheimnisse und Identität, während die Mädchen ihren Weg durch das Drama und die Geheimnisse finden, die sie umgeben. Die Serie bietet außerdem verschiedene Liebesbeziehungen, Familiendynamiken und Wendungen, die das Publikum bis zum Schluss im Ungewissen lassen.