Fernsehen:
* The Rookie (2018 – heute): Sergeant „Nyla“ Harper
* The Wire (2002-2008): Detektiv „Beadie“ Russell
* Six Feet Under (2001-2005): Brenda Chenowith
* ER (1994-2009): Dr. Janet Coburn
* Akte X (1993–2018): Dr. Anne Buckle
* Der Westflügel (1999–2006): Grace Barnett
* Die gute Frau (2009–2016): Richterin Christine „Chrissy“ Sexton
* Schloss (2009–2016): Detektiv Ryan „Ritter“ Russell
* Law &Order:Spezialeinheit für Opfer (seit 1999): Verschiedene Rollen
* Grey's Anatomy (2005-heute): Beth Hunter
* NCIS (2003-heute): Dr. Wendy Kieffer
* Criminal Minds (2005–2020): Dr. Erica Rinehart
* Moderne Familie (2009–2020): Schwester Pam
Film:
* Die Schwesternschaft der reisenden Hosen (2005): Frau Gold
* The Perfect Score (2004): Frau Baker
* The Day After Tomorrow (2004): Lucy Hall
* Der Prinz der Gezeiten (1991): Martha McMahon
* Thelma &Louise (1991): Carhop
* Das Schweigen der Lämmer (1991): Frau an der Tankstelle
* Der Spieler (1992): Sekretär
Dies ist nur eine unvollständige Liste, da Amy Aquino im Laufe ihrer Karriere an vielen anderen Projekten beteiligt war. Sie ist eine vielseitige Schauspielerin mit einer starken Präsenz sowohl auf der großen als auch auf der kleinen Leinwand.