Andererseits könnten die Geheimhaltung des Rosenkreuzerordens, seine Betonung der Symbolik und die hierarchische Natur seiner Organisation von einigen Kritikern als charakteristisch für einen Kult angesehen werden. Einige ehemalige Mitglieder des Rosenkreuzerordens haben ebenfalls Vorwürfe der Manipulation und finanziellen Ausbeutung geäußert. Diese Behauptungen beziehen sich jedoch nicht ausschließlich auf den Rosenkreuzerorden und sind nicht repräsentativ für alle Rosenkreuzergruppen.
Ob es sich beim Rosenkreuzerorden letztendlich um eine Sekte handelt, ist eine Ansichtssache und kann von den persönlichen Erfahrungen, Überzeugungen und Sichtweisen des Einzelnen abhängen.