2. Stationäre Phase :Bei der Gelelektrophorese ist die stationäre Phase ein Gel (Agarose oder Polyacrylamid), während bei der Papierchromatographie die stationäre Phase ein Blatt saugfähiges Papier ist.
3. Stofftrennung :Der Unterschied in der Bewegungsgeschwindigkeit durch die stationären Phasen trennt Substanzen in beiden Techniken.
4. Visualisierung :Nach der Trennung werden die Substanzen mithilfe geeigneter Färbe- oder Nachweismethoden sichtbar gemacht.