* Auflage: Einige Karten wurden in äußerst begrenzten Mengen gedruckt, beispielsweise Werbekarten oder solche, die bei bestimmten Veranstaltungen ausgegeben wurden.
* Bedingung: Der Zustand einer Karte hat großen Einfluss auf ihre Seltenheit. Eine Karte in makellosem, neuwertigem Zustand ist viel seltener als eine stark gespielte oder beschädigte.
* Ausgabe: Unterschiedliche Drucke derselben Karte können unterschiedliche Seltenheiten aufweisen, wobei frühe Ausgaben oft gefragter sind.
* Nachfrage: Auch die Beliebtheit und das Sammlerinteresse einer Karte können ihre wahrgenommene Seltenheit beeinflussen.
Hier sind jedoch einige Karten, die oft zu den seltensten zählen:
* Set „The Legendary Exodia“: Dieses Set aus fünf Karten ist bekanntermaßen selten, insbesondere die Karte „Exodia die Verbotene“, da sie nur im Set „Legend of Blue-Eyes White Dragon“ erhältlich war.
* „Super Secret Rare“ (SSR)-Karten: Diese Karten wurden zunächst in begrenzter Stückzahl gedruckt und erfreuen sich vor allem aus den älteren Sets großer Beliebtheit.
* „Gold Secret Rare“ (GSR)-Karten: Diese Karten wurden im Set „Magician's Force“ eingeführt und sind aufgrund ihrer begrenzten Auflage äußerst selten.
* „Ghost Rare“-Karten: Diese Karten wurden ursprünglich im Set „Duellant der Rosen“ eingeführt und verfügen über einen einzigartigen holografischen Effekt. Sie sind sehr sammelwürdig und selten.
* Karten „Limited Edition“ (LE): Diese Karten wurden in begrenzter Auflage gedruckt und werden oft bei besonderen Anlässen oder Turnieren verteilt.
Letztendlich ist die seltenste Yugioh-Karte diejenige, die in gutem Zustand am schwierigsten zu finden ist und bei Sammlern sehr begehrt ist.