Der Plan beginnt damit, dass Cyrus die Macht der mächtigen legendären Pokémon Cresselia und Darkrai nutzt. Cresselia soll die Macht des Mondes kontrollieren und Wünsche erfüllen können, während Darkrai mit Dunkelheit und Albträumen in Verbindung gebracht wird. Durch die Kombination ihrer Fähigkeiten beabsichtigt Cyrus, die Verzerrungswelt zu erschaffen und die Realität zu verändern.
Um seinen Plan in die Tat umzusetzen, strebt das Galaktische Imperium die Kontrolle über die Sinnoh-Region an, in der Cresselia und Darkrai leben sollen. Sie errichten verschiedene Stützpunkte in ganz Sinnoh und nehmen an Kämpfen gegen den Spielercharakter und sein Team teil. Eines ihrer bemerkenswerten Verstecke ist das Galaktische Hauptquartier in Veilstone City, das als Hauptknotenpunkt für ihre Operationen dient.
Im Verlauf des Spiels trifft der Spieler auf Mitglieder des Galaktischen Imperiums und entwirrt seine Pläne. Der Höhepunkt kommt, wenn der Spieler das geheime Versteck von Team Galactic, die Speersäule, erreicht, wo Cyrus versucht, die Verzerrungswelt zu erschaffen.
Der Spieler muss sich herausfordernden Kämpfen gegen galaktische Grunts, Kommandanten und sogar Cyrus selbst stellen. Wenn es dem Spieler gelingt, Cyrus zu besiegen, kann er letztendlich die Umsetzung seines Plans verhindern und den Frieden in der Sinnoh-Region wiederherstellen.
Der geniale Plan in Pokemon Light Platinum dient als zentrale Erzählung, die die Handlung des Spiels vorantreibt, und bereitet die Bühne für ein episches Abenteuer voller Schlachten, Rätsel und Begegnungen mit legendären Pokémon.