* Klavier: In Interviews hat er erwähnt, dass er Klavier spielt, und hat in einigen seiner Rollen sogar Klavier gespielt.
* Gitarre: Bei einigen seiner Fernsehauftritte konnte man ihn beim Gitarrespielen sehen und trat sogar mit einer Band auf.
* Schlagzeug: Bei einigen Auftritten stellte er seine Fähigkeiten als Schlagzeuger unter Beweis.
* Ukulele: Er hat eine Ukulele zu Hause und hat Interesse gezeigt, sie zu lernen.
Obwohl er kein professioneller Musiker ist, scheint Neil Patrick Harris Spaß daran zu haben, verschiedene Instrumente zum Spaß zu spielen und hat sie sogar in seine Arbeit integriert.