1. Flucht vor Miss Hannigan: Annie entkommt mithilfe ihrer neuen Freunde erfolgreich den Fängen von Miss Hannigan, der grausamen Waisenhausleiterin.
2. Enthüllung des Geheimnisses von Daddy Warbucks: Annie erfährt die Wahrheit über Daddy Warbucks, den wohlhabenden Geschäftsmann, der ihr Vormund wird, als er verrät, dass er derjenige war, der die „Daddy“-Briefe an das Waisenhaus geschickt hat.
3. Annahme: Annie wird in einer herzerwärmenden Zeremonie offiziell von Daddy Warbucks adoptiert, umgeben von ihren Freunden aus dem Waisenhaus, und sie werden eine liebevolle Familie.
4. Politischer Sieg: Daddy Warbucks nutzt seinen Einfluss und seinen Reichtum, um Präsident Franklin D. Roosevelts Wiederwahlkampagne zu unterstützen, was zu einem Sieg führt, der die Moral der Nation während der Weltwirtschaftskrise stärkt.
5. Glücklich bis ans Ende: Das Musical endet damit, dass Annie und Daddy Warbucks zusammen mit ihrem neuen Hundegefährten Sandy und den Waisenkindern, die ebenfalls ein Zuhause gefunden haben, glücklich bis ans Ende ihrer Tage in ihrem großen Herrenhaus leben.
6. Finale: Die letzte Szene zeigt Annie und ihre Freunde, wie sie ihre Freude und ihren Optimismus für die Zukunft zum Ausdruck bringen, indem sie Hand in Hand das erhebende Lied „Tomorrow“ singen.