Im Laufe des Romans begeben sich Jim und seine Freunde, darunter Dr. Livesey und Squire Trelawney, auf eine gefährliche Reise, um den Schatz vor Silvers Crew zu finden. Der Konflikt verschärft sich, wenn sie mit verschiedenen Hindernissen konfrontiert werden, darunter Stürme, tückisches Gelände und Konfrontationen mit den Piraten. Zum ultimativen Zusammenstoß kommt es, wenn die Piraten meutern und versuchen, die Kontrolle über das Schiff zu übernehmen, was zu einem entscheidenden Kampf zwischen Jim und seinen Verbündeten gegen Silver und seine Männer führt.
Im Kern wird der Konflikt in „Treasure Island“ durch das Streben nach Reichtum und Gier sowie den Kampf um Macht und Kontrolle angetrieben. Die Beweggründe und Wünsche der Charaktere bringen sie in Konflikt miteinander und sorgen im Verlauf der Geschichte für Spannung und Spannung. Darüber hinaus beleuchtet der Konflikt das Thema Gut gegen Böse, da Jim und seine Freunde für Ehrlichkeit und Loyalität stehen, während Silver und seine Crew für Betrug und Verrat stehen.