Nach Alisons Verschwinden ein Jahr zuvor erhalten die Pretty Little Liars anonyme Nachrichten von jemandem namens „A“, der damit droht, ihre dunkelsten Geheimnisse preiszugeben. Während die Mädchen versuchen herauszufinden, wer hinter diesen Botschaften steckt, stoßen sie auf lange verborgene Wahrheiten und sehen sich einer Gefahr gegenüber, die ihr Leben bedroht. Sie müssen zusammenarbeiten, um das Geheimnis von Alisons Verschwinden zu lüften und die Identität von „A“ zu entlarven, bevor es zu spät ist.
Im Laufe der Show tauchen die Liars tiefer in die komplexen Geheimnisse und Dramen ihres eigenen Lebens und ihrer Beziehungen zu ihren jeweiligen Liebesinteressen, Freunden und Familienmitgliedern ein. Durch Wendungen und unerwartete Allianzen spinnt „Pretty Little Liars“ ein spannendes Netz aus Mysterium, Spannung und Freundschaft, während die Mädchen sich ihrer Vergangenheit stellen, ihre Stärken annehmen und sich den Kräften stellen, die sie von Anfang an verfolgt haben.