Die Boutique wurde vom Freund und künstlerischen Mitarbeiter der Beatles, Simon Posthuma, entworfen, der auch ihre Albumcover und anderes Werbematerial entworfen hat. Es sollte ein Einzelhandelsgeschäft für Waren im Zusammenhang mit den Beatles und anderen mit Apple Records verbundenen Künstlern sein, darunter Kleidung, Accessoires und Haushaltswaren.
Der Laden war für sein farbenfrohes und psychedelisches Dekor bekannt, das die Ästhetik der späten 1960er Jahre widerspiegelte. Es wurden auch von den Beatles selbst entworfene Artikel wie T-Shirts, Schals und Schmuck gezeigt.
Allerdings stand die Apple Boutique von Anfang an vor Herausforderungen, darunter mangelnde Managementerfahrung, finanzielles Missmanagement und die Konkurrenz durch andere Geschäfte. Die Beatles hatten auch Schwierigkeiten mit dem Mietvertrag für das Grundstück und Meinungsverschiedenheiten zwischen ihnen und ihren Beratern über die Ausrichtung des Ladens.
Infolgedessen wurde die Apple Boutique im August 1968 nach nur einem Jahr in Betrieb geschlossen. Die Beatles erlitten durch das Vorhaben erhebliche finanzielle Verluste und die Schließung des Ladens bedeutete das Ende ihrer direkten Beteiligung am Einzelhandelsgeschäft.