Dieser Schwierigkeitsgrad ist der einfachste im Spiel und gilt im Allgemeinen als fehlerverzeihender als die anderen Schwierigkeitsgrade. Feinde sind weniger aggressiv und haben weniger Gesundheit, und das Spiel gibt dem Spieler mehr Leben und geht weiter.
Schwer:Dieser Schwierigkeitsgrad ist anspruchsvoller als „Normal“, aber dennoch relativ fehlerverzeihend. Feinde sind aggressiver und haben mehr Gesundheit, und das Spiel gibt dem Spieler weniger Leben und geht weiter.
Sehr schwer:Dies ist der anspruchsvollste Schwierigkeitsgrad im Spiel und sehr unerbittlich. Feinde sind extrem aggressiv und haben viel Gesundheit, und das Spiel gibt dem Spieler nur sehr wenige Leben und geht weiter. Dieser Schwierigkeitsgrad wird weder Anfängern noch Gelegenheitsspielern empfohlen.
Zusätzlich zu den drei Hauptschwierigkeitsstufen gibt es auch eine Reihe geheimer Schwierigkeitsgrade, die im Spiel freigeschaltet werden können. Diese geheimen Schwierigkeitsgrade sind noch anspruchsvoller als der Schwierigkeitsgrad „Sehr schwer“ und werden nur den erfahrensten Sonic Heroes-Spielern empfohlen.