Im Verlauf der Geschichte kommt es jedoch zu Spannungen, als eine ausgewählte Gruppe von Schweinen beginnt, ihre Artgenossen zu manipulieren und auszubeuten. Der Konflikt verschärft sich, als die Schweine unter der Führung des listigen und autoritären Ebers Napoleon beginnen, die Sieben Gebote – die Leitprinzipien der Farm – zu ändern, um ihren eigenen Interessen zu dienen.
Napoleon und seine Mitschweine übernehmen nach und nach Führungsrollen und etablieren ein hierarchisches System, das sie über die anderen Tiere stellt. Dies führt zu einer tiefen Kluft innerhalb der Tiergemeinschaft, da Napoleon und seine Handlanger Privilegien und Luxus genießen, während der Rest der Tiere für den Unterhalt der Farm schuftet.
Der Konflikt dreht sich um das Machtstreben der Schweine und den Kampf der anderen Tiere um die Aufrechterhaltung der Ideale ihrer ursprünglichen Rebellion. Letztlich wird Animal Farms Auseinandersetzung mit den Herausforderungen bei der Förderung echter Gleichheit zu einer Kritik an totalitären Gesellschaften und der Korruption scheinbar edler Ideologien.